Специализирани бактерии , намиращи се в почвата изпълняват азота , който е процес на превръщане на атмосферно N2 , който е химически инертен , в използваеми форми на азот , като амониев и нитрати . Азот фиксиране също се появява в резултат на удар от мълния . Азотът , който е бил фиксиран , се съхранява в почвата, където тя може да се използва от растенията . Наем азотиране
Допълнителни бактерии в почвата са отговорни за превръщането на амоняк в почвата в нитрати в процес, наречен нитрификация . Амонякът е различно съединение от амониев и не може да се използва от растенията . Ето защо бактериите в почвата трябва да го окисляват да образуват нитрати, която растенията могат да използват, за да образуват протеини.