Основният проблем с изкуствени езера е, че те са изкуствени и така трябва да бъде конструирана. Изграждането на язовир изисква спиране на реката тече надолу по веригата , включва изграждането на пътища за достъп и изисква голямо количество на човешката дейност , както по време на строителството и експлоатацията на язовира . Животните и растенията, които използват, за да живеят по-надолу по реката , особено риба и морски растения , изведнъж вече нямат местообитание . Наем екосистемни
водноелектрически язовири , въпреки Поради изложените по- горе, са били похвалени за най-малко създаването на алтернативен среда за животни и растения. Mining , например, оставя след себе си няма алтернатива екосистема. Изкуствени езера могат да бъдат големи местообитания за редица животни , тъй като те обикновено са защитени от закона и са в полза на сигурността, добавени за защита на язовира.