Какви са ефектите на алкално рН на структурата на ДНК

? Обикновено всяка ДНК молекула във вашите клетки съдържа две направления свързани помежду си чрез взаимодействия наречените водородни връзки . Промени в условия , обаче , може да " денатуриране " ДНК и да предизвикат тези направления да се разделят. Добавяне на силни основи , като натриев хидроксид , значително увеличава рН , което намалява концентрацията на водороден йон на разтвора и денатуриране на двойно - верижна ДНК . Влияние на рН

йонна концентрация хидроксид и рН имат пряка връзка , което означава, че по-високо рН , по-висока концентрация на хидроксид . Също така , най-ниската концентрация на водородни йони пада. При високо рН , след което разтворът е богат на хидроксидни йони , и тези отрицателно заредени йони може да тегли водородни йони на разстояние от молекули като базовите двойки в ДНК . Този процес нарушава водородни връзки , който държи двете ДНК вериги заедно , като ги кара да се разделят.


RNA срещу ДНК

разлика от РНК , ДНК липсва хидроксилна група на позиция 2 ' във всяка захар група . Тази разлика прави ДНК много по-стабилна в алкален разтвор . В РНК , хидроксилната група на позиция 2 ' може да се откажат от водородни йони към разтвора при високо рН , за създаване на силно реактивна алкоксид йон , който атакува фосфатната група държи два съседни нуклеотиди заедно . ДНК не страдат от този дефект и по този начин се радва на забележителна стабилност при високо рН . Продажба и Наем на Alkaline лизиране

молекулярни биолози често се възползват от алкална денатурация да се изолира плазмид ДНК от бактерии . Плазмидите са малки бримки на ДНК се разделят от бактериална хромозома . В алкален лизис Miniprep , биолози добави детергент и натриев хидроксид до бактерии суспендират в разтвор . Препаратът се разтваря бактериалната клетъчната мембрана , а натриев хидроксид повишава рН и прави силно алкален разтвор . Тъй като счупени клетки освобождават тяхното съдържание , ДНК вътре разделя на съставните си нишки , или денатурира .


Reannealing

След биолога извлича ДНК от клетката , той добавя друг реагент, за да се върне на решение за по-неутрално рН и се утаи препарат. Промяната в рН позволява на плазмид Нишките reanneal; обемисти хромозомата , обаче , не може да направи същото , така че биологът може да го отстрани заедно с почистващ препарат , денатурирани протеини и други разнообразни боклуци , оставяйки зад плазмид . Алкални лизис не напълно пречиства плазмид ДНК; Вместо това, тя служи като " бързо и мръсно " начин, за да го извлечете от клетката и премахване на повечето други замърсители.