В TEM , тънък резен на извадка седи в специална вакуумна камера . Лъч на електрони преминава през пробата и става увеличен от магнитни полета , действащи като лещи . Електроните произвеждат блясък на екрана на фосфор , които учените виждат директно или съхранявате като файлове с изображения на данни. Микроскоп сканиращ електронен използва тънък електронен лъч за сканиране на повърхността на обекта. Електроните и други видове радиация разпръсват от повърхността на обекта и се качват от датчици . Детекторите преобразуват разсеяна радиация в образ . В сканиращ електронен микроскоп , електрони не преминават през пробата при проучване
Object Size
Само много тънки проби работят за TEM .; проба, която е на повече от 1000 ангстрьома или 100 нанометра дебели блокове електрони , и се разваля техници с изображения се подготвят пробите чрез внимателно подкосяване тънки секции на по-големи обекти. СЕМ , от друга страна , изображения на повърхността на проби по-голям от камера микроскоп позволява; до няколко сантиметра .